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OmicSpace IIS LaFe

Catálogo de Espacio de Datos

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¿Qué es el catálogo del Espacio de Datos de OmicSpace?

El catálogo de OmicSpace es una herramienta diseñada para facilitar la búsqueda y comprensión de conjuntos de datos en investigación biomédica y ciencias ómicas. 

Permite a los usuarios: 

  • Descubrir datos disponibles 
  • Conocer sus características principales 
  • Evaluar su utilidad para proyectos de investigación 

¿No encuentras el dataset que buscas?

El catálogo de OmicSpace es un entorno en constante evolución. Debido al nivel de digitalización de los distintos nodos, es posible que algunos conjuntos de datos aún no estén disponibles o publicados. 

Si no encuentras el dataset que necesitas, puedes contactarnos indicando tu interés. Nuestro equipo evaluará la viabilidad de la solicitud y, en su caso, podrá impulsar la generación o incorporación del activo en el catálogo. 

El Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud IACS es la entidad que promueve en Aragón el conocimiento en Biomedicina y Ciencias de la Salud. Su creación se sustenta en la Ley 6/2002, de 15 de abril, de Salud de Aragón, que establece que el IACS es una entidad de Derecho Público adscrita al departamento responsable de Salud del Gobierno de Aragón y  le dota de personalidad jurídica y patrimonio propio.

Nº aproximado de pacientes:

1.4 millones

Ventana temporal de datos:

desde 2012

 

Frecuencia actualización:

diaria

 

Tipología de datos:
HCE, Biobanco, Laboratorio, Registro de tumores, Registro de vacunas, Datos genómicos de pruebas concretas no secuenciadas, Supervivencia

Estándares utilizados:

OMOP CDM (5.4)

Vocabularios y ontologías:

OMIM, ATC, ORPHANET

Infraestructura:

BBDD no-SQL, BBDD relacional

 

Cobertura asistencial:

Atención primaria, Atención primaria nivel especialista, Atención especializada ambulatoria, Hospitalización, Consultas externas, Urgencias

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Información sobre enfermedad específica, Alta hospitalaria, Ingreso en UCI, Prescripción, Dispensación, Anticoncepción, Administración de vacunas, Medidas clínicas, Proveedor sanitario, Datos genéticos, Datos de biomarcadores, Resultados referidos por el paciente (PRO), Identificadores únicos de personas, Códigos diagnósticos, Embarazo y neonatos, Procedimientos
Grupos de edad incluidos
Todas las edades
Información demográfica disponible
Edad, Sexo/Género, País de origen, Área de salud, Localización geográfica y sanitaria
Factores de estilo de vida
Consumo de tabaco, Consumo de alcohol, Dieta, Actividad física
Información adicional relevante
Actualmente se están integrando datos genómicos
Disponibilidad de biobanco asociado
Vinculación parcial /ad hoc
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Parcialmente
Información ómica disponible
Parcialmente

El Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Universitario La Paz (IdiPAZ) se concibe como un espacio de investigación biomédica multidisciplinar y traslacional orientado a la investigación básica, clínica, epidemiológica y en servicios de salud, fruto de la relación entre el Hospital Universitario La Paz (HULP), la Universidad Autónoma de Madrid (UAM), el Hospital Universitario de Getafe (HUG), la Universidad Europea (EU) y la Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Universitario La Paz (FIBHULP).

Nº aproximado de pacientes:

558

Ventana temporal de datos:

01/09/2024 – 31/08/2025

 

Frecuencia actualización:

Actualización propia 

Tipología de datos:

Datos genómicos Ómicos

Estándares utilizados:

Formato Local

OTRAS CATEGORÍAS

Cobertura asistencial 
Consultas externas 
Elementos clínicos recogidos
Identificadores únicos de personas; Datos genéticos 
Grupos de edad incluidos
Adultos (18–45 años, 46–64 años, 65–74 años, 75–84 años y ≥85 años) 
Factores de estilo de vida
No recoge este tipo de información 
Disponibilidad de biobanco asociado
Sí, pero sin vinculación a la historia clínica electrónica (HCE) 
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Datos sociodemográficos 
Información ómica disponible
Genómica 
Tipo de análisis genómico implementado 
Farmacogenómica 

El Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria (IMIB) es la unión de investigadores del ámbito biosanitario que pertenecen al Servicio Murciano de Salud y/o a las Universidades de la Región de Murcia.

Nº aproximado de pacientes:

4.500

Ventana temporal de datos:

2015–2026 

 

Frecuencia actualización:

trimestral

Tipología de datos:

Datos de biobanco 

Estándares utilizados:

OMOP CDM (v5.3) 

Terminologías clínicas:

CIE-10, SNOMED CT 

Infraestructura:

Base de datos relacional y base de datos NoSQL 

Cobertura asistencial:

Hospitalización; consultas externas 

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Enfermedades raras; alta hospitalaria; prescripción; datos de biomarcadores; códigos diagnósticos; información sobre enfermedad específica; hábitos de vida
Grupos de edad incluidos
Población pediátrica (<18 años), niños (2–11 años), adolescentes (12–17 años), adultos (18–45 años, 46–64 años), personas mayores (65–74 años, 75–84 años y ≥85 años) 
Información demográfica disponible
Edad; sexo/género; área de salud 
Factores de estilo de vida
Consumo de tabaco, Consumo de alcohol, Dieta, Actividad física
Disponibilidad de biobanco asociado
Vinculación parcial /ad hoc
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Datos clínicos asociados 
Información ómica disponible
Genómica 
Tipo de análisis genómico implementado 
Exoma completo (WES) 
Datasets disponibles y características 
IMIB Biobank, compuesto por varios datasets relacionados con enfermedades cardiovasculares, hematológicas, neurológicas, neoplásicas, infecciosas y enfermedades raras 

El Hospital del Mar Research Institute forma parte del Hospital del Mar, y está formado por más de 700 profesionales, con una composición mixta de investigadores del Hospital del Mar Research Institute e investigadores clínicos del Hospital del MAR y otros investigadores de la Universitat Pompeu Fabra(UPF), la Universitat Autònoma de Barcelona (UAB) y la Fundación BarcelonaBeta Brain Research Center (BBRC).

Nº aproximado de pacientes:

1.800.000

Ventana temporal de datos:

1990–2026

 

Frecuencia actualización:

Semestral

 

Tipología de datos:

HCE, Registro de tumores, Registro de vacunas, Laboratorio, Datos genómicos

Estándares utilizados:

OMOP CDM (v5.4) 

Terminologías clínicas:

CIE-9-MC, CIE-10, LOINC, SNOMED-CT

Infraestructura:

BBDD relacional

Cobertura asistencial:

Atención primaria, Hospitalización, Consultas externas

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Información sobre enfermedad específica, Enfermedades raras, Alta hospitalaria, Ingreso en UCI, Causa de muerte, Prescripción, Dispensación, Administración de vacunas, Medidas clínicas, Datos de biomarcadores, Resultados referidos por el paciente (PRO), Códigos diagnósticos, Embarazo y neonatos, Procedimientos, Identificadores únicos de personas
Grupos de edad incluidos
Todas las edades
Información demográfica disponible
Edad, Sexo/Género
Factores de estilo de vida
Consumo de tabaco, Consumo de alcohol
Disponibilidad de biobanco asociado
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Información ómica disponible
No dispone de información ómica
Tipo de análisis genómico implementado 
Datasets disponibles y características 

El Hospital Sant Joan de Déu es un hospital dedicado a la atención integral de mujeres, niños y adolescentes y, en la actualidad, uno de los centros pediátricos de alta especialización más importantes de Europa.

Nº aproximado de pacientes:

311

Ventana temporal de datos:

2001–Actualidad

Frecuencia actualización:

Diaria

 

Tipología de datos:

HCE, Laboratorio

Estándares utilizados:

OMOP CDM (v5.4) 

Terminologías clínicas:

LOINC, SNOMED-CT

Infraestructura:

Cobertura asistencial:

Hospitalización, Consultas externas

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Enfermedades raras, Medidas clínicas, Datos de biomarcadores
Grupos de edad incluidos
Población pediátrica (<18 años)
Información demográfica disponible
Edad, Sexo/Género
Factores de estilo de vida
Disponibilidad de biobanco asociado
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Información ómica disponible
Tipo de análisis genómico implementado 
Datasets disponibles y características 
Pacientes con sospecha o diagnóstico de enfermedades metabólicas congénitas. Aproximadamente 20.000 registros. Actualización diaria. Ventana temporal: 2001–actualidad.

La Fundación Progreso y Salud, organización sin ánimo de lucro perteneciente a la Consejería de Salud y Consumo de la Junta de Andalucía, es la entidad central de apoyo y gestión de la investigación del Sistema Sanitario Público Andaluz, teniendo como principal objetivo, impulsar de forma efectiva la investigación e innovación en Salud en la comunidad autónoma de Andalucía.

Nº aproximado de pacientes:

200

Ventana temporal de datos:

2019–2025 

 

Frecuencia actualización:

Anual

Infraestructura:

BBDD NoSQL 

Tipología de datos:

Datos genómicos

Cobertura asistencial:

Investigación

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Enfermedades raras
Grupos de edad incluidos
Adultos (18–45 años), Adultos (46–64 años)
Información demográfica disponible
Sexo/Género
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Datos sociodemográficos
Información ómica disponible
Genómica 
Tipo de análisis genómico implementado 
Exoma completo (WES) 
Datasets disponibles y características 
Datos genómicos de población romaní española
El Instituto de Investigación Sanitaria y Biomédica de Alicante, ISABIAL, es un espacio de investigación biomédica multidisciplinar, orientado a la investigación básica, clínica, epidemiológica y en servicios de salud. Su misión ese mejorar la calidad de la investigación biomédica en Alicante, colaborando con investigadores y grupos de investigación, incluyendo Atención Primaria, del Departamento de Salud Alicante-Hospital General, la Universidad de Alicante (UA) y la Universidad Miguel Hernández (UMH).

Nº aproximado de pacientes:

280.000

Ventana temporal de datos:

2013–2025 

 

Frecuencia actualización:

Semanal

Tipología de datos:

HCE, Datos genómicos, Biobanco, Registro de tumores, Registro de vacunas, Laboratorio, Imagen, Secuenciación, Supervivencia, Datos ómicos

Estándares utilizados:

OMOP CDM (v5.4) 

Terminologías clínicas:

CIE-9-MC, CIE-10, LOINC, SNOMED-CT

Infraestructura:

Base de datos relacional, DICOM

Cobertura asistencial:

Hospitalización, Consultas externas

OTRAS CATEGORÍAS

Elementos clínicos recogidos
Información sobre enfermedad específica, Enfermedades raras, Alta hospitalaria, Ingreso en UCI, Causa de muerte, Prescripción, Administración de vacunas, Productos sanitarios, Medidas clínicas, Datos genéticos, Datos de biomarcadores, Códigos diagnósticos, Embarazo y neonatos, Procedimientos
Grupos de edad incluidos
Todas las edades
Información demográfica disponible
Edad, Sexo/Género, País de origen, Estado civil, Nivel de estudios, Área de salud
Factores de estilo de vida
Consumo de tabaco, Consumo de alcohol, Dieta, Actividad física
Información adicional relevante
Se está desarrollando un lago de datos como fuente principal con estándares, ontologías y actualización periódica a partir de la asistencia sanitaria del Departamento de Salud Alicante–Hospital General para uso secundario. Además, se están generando conjuntos de datos procedentes de proyectos de investigación financiados con fondos públicos, que serán catalogados desde la entidad. 
Disponibilidad de biobanco asociado
Sí, con vinculación sistemática a la HCE
Disponibilidad de metadatos asociados a muestras
Datos clínicos asociados
Información ómica disponible
Varias
Tipo de análisis genómico implementado 
WGS, RNA-seq y farmacogenómica
Datasets disponibles y características 
Se está desarrollando un lago de datos como fuente de datos principal, basado en estándares y ontologías, con actualización periódica y orientado al uso secundario de los datos asistenciales. Además, se están generando datasets específicos derivados de proyectos de investigación financiados con fondos públicos que serán incorporados al catálogo de la entidad.

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Contáctanos y te ayudamos a resolver tus dudas:
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También puedes llamarnos y contarnos en el +34 961 41 16 92 (246607)

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